Mô tả
1stBASE cung cấp toàn diện giải pháp cho Next Generation Sequencing từ tư vấn đến báo cáo kết quả cuối cùng.
- Dịch vụ chuẩn bị mẫu: tách chiết DNA/RNA từ nhiều loại mẫu
- Báo cáo QC cho mẫu
- Chuẩn bị thư viện với chất lượng cao
- Báo cáo QC cho thư viện
- Chạy mẫu
- Phân tích kết quả và gửi báo cáo
Các ứng dụng của NGS bao gồm
- Whole genome sequencing ( WGS)
- Whole exome sequencing ( WES)
- Transcriptome Sequencing ( RNA-seq)
- Metagenomics Sequencing : các dịch vụ gồm có 16S/18S/ITS Amplicon Sequencing, Shotgun Metagenomics, Shotgun Metatranscriptomics etc.
- Epigenome Sequencing : dịch vụ gồm có Methylation Sequencing, MBD ( Methyl-CpG binding domain) Sequencing, ChIP- (Chromatin Immuno Precipitation) sequencing
- Genotyping By Sequencing ( GBS)
- Next Restriction site Associated DNA sequecing ( NextRAD Seq)
- Mitochondiral DNA Sequencing ( mtDNA Seq)
- Custom Targeted Sequencing
Yêu cầu về gửi mẫu
| Loại mẫu |
Vol |
Nồng độ tối thiểu |
Amount |
A260/A280 |
A260/A230 |
RNA Integrity Number |
| gDNA |
>40 ul |
20ng/ul |
>2 ug |
>1.8 |
>2 |
- |
| Low input DNA library (such as FFPE) |
>40 ul |
20ng/ul |
>2 ug |
>1.8 |
>2 |
- |
| PCR-free gDNA |
>40 ul |
20ng/ul |
>2 ug |
>1.8 |
>2 |
- |
| Total RNA |
>40 ul |
20ng/ul |
>2 ug |
>1.8 |
>2 |
> 7.5 |
| small RNA/microRNA |
>40 ul |
20ng/ul |
>2 ug |
>1.8 |
>2 |
> 7.5 |
